Hoewel de WakeUp Pro veel functies bevat, zijn er ook duidelijke beperkingen. De bediening kan in het begin onoverzichtelijk aanvoelen doordat veel knoppen meerdere functies hebben en er geen uitgebreide, duidelijk genummerde handleiding bij zit. Dat betekent dat je even moet wennen om snel alarmen, kleuren en tijden in te stellen. Voor sommige gebruikers kan dit frustrerend zijn, zeker als je snel iets wilt aanpassen in het donker.
Verder is de geluidskwaliteit van de ingebouwde natuurgeluiden en de FM-radio vrij basic. De geluiden missen soms diepte en variatie waardoor ze minder natuurlijk overkomen dan op duurdere apparaten of speciale apps. De maximale volumeregeling kan niet voor iedereen voldoende zijn, en bij hogere volumes treedt wel eens vervorming op. Ook het display en de helderheidsregeling zijn niet optimaal: de displayverlichting kan in een donkere slaapkamer te fel zijn, en hoewel er dimopties zijn, missen deze vaak fijne stappen om de perfecte balans te vinden.
Tot slot is de bouw en het materiaalgebruik functioneel maar niet premium. De behuizing voelt licht aan en de knoppen hebben een minder solide klik dan bij hogere prijsklassen. Dit alles betekent dat de WakeUp Pro een sterke prijs-kwaliteitverhouding heeft, maar dat trouwe gebruikers die veel fijnregeling en audiofidelity verwachten, mogelijk teleurgesteld raken.